설훈 의원은 1977년 긴급조치 9호를 위반한 혐의로 2년6개월을 선고받고 복역했다. 당시 나이 24살이었다.

설훈 의원은 지난해 6월9일 19대 국회 첫 정기국회 정치분야 대정부질문에서 당시 배석 판사로 현장에 있었던 김황식 국무총리에게 “1977년 당시 판사였던 김 총리가 긴급조치 9호 위반으로 내게 2년6개월을 선고한 점을 기억하느냐. 피고인 설훈에게 답변해 보라”고 묻기도 했다.
그러면서 “우리는 이렇게 참혹한 역사를 만든 유신의 관계자들에게 책임을 물었던 적이 있느냐. 법적인 책임은 몰라도 최소한 사회적, 도의적 책임을 지도록 해야 하는 것 아니냐”고 질타한 바 있다.

설훈 의원은 1980년 광주민주화운동 당시 정보기관이 조작한 ‘김대중 내란 음모사건’으로 7년을 선고받고 2년6개월의 감옥생활을 했으며, 지난 2003년 1월 재심을 통해 23년만에 무죄 판결을 받은 바 있다.

설훈 의원은 36년만에 받은 재판부의 무죄 판결에 대해 “지금이라도 역사 앞에서 정당한 평가를 받아 진심으로 기쁘게 생각한다”면서 “이번 판결이 모든 정권의 반면교사가 되어 대한민국이 온전한 민주주의가 실현되는 국가로 큰 발걸음을 내딛는 계기가 돼야 할 것”라고 소감을 밝혔다.